MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldisphaera lagunensis DSM 15908 chromosome

Total Repeats: 35376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019791	TGA	2	6	75	80	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
2	NC_019791	GCA	2	6	91	96	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216256
3	NC_019791	GA	3	6	120	125	50 %	0 %	50 %	0 %	429216256
4	NC_019791	TAT	2	6	128	133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216256
5	NC_019791	TTC	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216256
6	NC_019791	GAT	2	6	169	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
7	NC_019791	TTTA	2	8	238	245	25 %	75 %	0 %	0 %	429216256
8	NC_019791	AGA	2	6	300	305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
9	NC_019791	ATT	2	6	398	403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216256
10	NC_019791	TA	3	6	490	495	50 %	50 %	0 %	0 %	429216256
11	NC_019791	A	6	6	526	531	100 %	0 %	0 %	0 %	429216256
12	NC_019791	GAT	2	6	538	543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
13	NC_019791	TTA	2	6	544	549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216256
14	NC_019791	ATA	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216256
15	NC_019791	AGC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216256
16	NC_019791	GAA	3	9	667	675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
17	NC_019791	T	6	6	680	685	0 %	100 %	0 %	0 %	429216256
18	NC_019791	ATG	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
19	NC_019791	AT	3	6	713	718	50 %	50 %	0 %	0 %	429216256
20	NC_019791	GCA	2	6	784	789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216256
21	NC_019791	GCT	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216256
22	NC_019791	TGT	2	6	876	881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216256
23	NC_019791	GAT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
24	NC_019791	TAGGG	2	10	927	936	20 %	20 %	60 %	0 %	429216256
25	NC_019791	GTA	2	6	940	945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
26	NC_019791	TAA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216256
27	NC_019791	ATT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216256
28	NC_019791	AT	4	8	1031	1038	50 %	50 %	0 %	0 %	429216256
29	NC_019791	A	6	6	1048	1053	100 %	0 %	0 %	0 %	429216256
30	NC_019791	AGA	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
31	NC_019791	AAG	2	6	1089	1094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
32	NC_019791	ATC	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216256
33	NC_019791	AAT	2	6	1146	1151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216256
34	NC_019791	GGC	2	6	1191	1196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429216256
35	NC_019791	AGA	2	6	1227	1232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216256
36	NC_019791	ATG	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
37	NC_019791	ATA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216256
38	NC_019791	A	6	6	1281	1286	100 %	0 %	0 %	0 %	429216256
39	NC_019791	TGA	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216256
40	NC_019791	TAT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216257
41	NC_019791	TGT	2	6	1468	1473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216257
42	NC_019791	CTAA	2	8	1535	1542	50 %	25 %	0 %	25 %	429216257
43	NC_019791	TA	4	8	1558	1565	50 %	50 %	0 %	0 %	429216257
44	NC_019791	A	6	6	1582	1587	100 %	0 %	0 %	0 %	429216257
45	NC_019791	A	7	7	1664	1670	100 %	0 %	0 %	0 %	429216257
46	NC_019791	G	6	6	1707	1712	0 %	0 %	100 %	0 %	429216257
47	NC_019791	AGA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216257
48	NC_019791	ATA	2	6	1793	1798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216257
49	NC_019791	ATT	2	6	1817	1822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216257
50	NC_019791	TTC	2	6	1969	1974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216258
51	NC_019791	TAG	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216258
52	NC_019791	ATT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216258
53	NC_019791	ATA	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216258
54	NC_019791	TTA	2	6	2051	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216258
55	NC_019791	ATA	3	9	2078	2086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216258
56	NC_019791	TAA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216258
57	NC_019791	ATT	2	6	2186	2191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216258
58	NC_019791	GAT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216258
59	NC_019791	TA	4	8	2338	2345	50 %	50 %	0 %	0 %	429216258
60	NC_019791	CAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216258
61	NC_019791	ATT	2	6	2377	2382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216258
62	NC_019791	AGG	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216258
63	NC_019791	CAATA	2	10	2484	2493	60 %	20 %	0 %	20 %	429216258
64	NC_019791	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	429216258
65	NC_019791	TA	3	6	2534	2539	50 %	50 %	0 %	0 %	429216258
66	NC_019791	TAAA	2	8	2658	2665	75 %	25 %	0 %	0 %	429216258
67	NC_019791	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	429216258
68	NC_019791	A	6	6	2798	2803	100 %	0 %	0 %	0 %	429216258
69	NC_019791	A	6	6	2805	2810	100 %	0 %	0 %	0 %	429216258
70	NC_019791	CTTTC	2	10	2897	2906	0 %	60 %	0 %	40 %	429216259
71	NC_019791	GAC	2	6	2994	2999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429216259
72	NC_019791	AATG	2	8	3256	3263	50 %	25 %	25 %	0 %	429216260
73	NC_019791	GAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216260
74	NC_019791	ATT	2	6	3311	3316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216260
75	NC_019791	GGA	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216260
76	NC_019791	TATT	2	8	3375	3382	25 %	75 %	0 %	0 %	429216261
77	NC_019791	CTT	2	6	3442	3447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
78	NC_019791	TTCT	2	8	3491	3498	0 %	75 %	0 %	25 %	429216261
79	NC_019791	ACT	2	6	3510	3515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216261
80	NC_019791	AGG	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216261
81	NC_019791	ATA	2	6	3584	3589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216261
82	NC_019791	T	6	6	3627	3632	0 %	100 %	0 %	0 %	429216261
83	NC_019791	TTC	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
84	NC_019791	TAT	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
85	NC_019791	AGA	2	6	3749	3754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216261
86	NC_019791	ATT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
87	NC_019791	TA	3	6	3847	3852	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
88	NC_019791	TTAAAT	2	12	3856	3867	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
89	NC_019791	TAAT	2	8	3882	3889	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
90	NC_019791	GAT	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216261
91	NC_019791	TTA	2	6	3930	3935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
92	NC_019791	ATTA	2	8	3944	3951	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
93	NC_019791	ATC	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216261
94	NC_019791	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
95	NC_019791	TGA	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216261
96	NC_019791	TTC	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
97	NC_019791	TTAA	2	8	4167	4174	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
98	NC_019791	TATC	2	8	4189	4196	25 %	50 %	0 %	25 %	429216261
99	NC_019791	TAT	2	6	4210	4215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
100	NC_019791	TTAA	2	8	4281	4288	50 %	50 %	0 %	0 %	429216261
101	NC_019791	AAG	2	6	4301	4306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216261
102	NC_019791	TAT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216261
103	NC_019791	AGG	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216261
104	NC_019791	CA	3	6	4396	4401	50 %	0 %	0 %	50 %	429216261
105	NC_019791	ACCA	2	8	4438	4445	50 %	0 %	0 %	50 %	429216261
106	NC_019791	TTTG	2	8	4517	4524	0 %	75 %	25 %	0 %	429216261
107	NC_019791	AATTT	2	10	4573	4582	40 %	60 %	0 %	0 %	429216261
108	NC_019791	GCT	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216261
109	NC_019791	ATC	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216261
110	NC_019791	TTC	2	6	4646	4651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
111	NC_019791	CATT	2	8	4674	4681	25 %	50 %	0 %	25 %	429216261
112	NC_019791	AGG	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216261
113	NC_019791	CTT	2	6	4723	4728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429216261
114	NC_019791	GAA	2	6	4951	4956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216262
115	NC_019791	TAA	2	6	4962	4967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216262
116	NC_019791	CTC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429216262
117	NC_019791	A	6	6	5132	5137	100 %	0 %	0 %	0 %	429216262
118	NC_019791	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216262
119	NC_019791	AAC	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429216262
120	NC_019791	GAG	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216262
121	NC_019791	T	6	6	5290	5295	0 %	100 %	0 %	0 %	429216262
122	NC_019791	AGG	2	6	5367	5372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216262
123	NC_019791	GA	3	6	5422	5427	50 %	0 %	50 %	0 %	429216262
124	NC_019791	TAG	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216262
125	NC_019791	TAG	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216262
126	NC_019791	ATT	2	6	5646	5651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429216262
127	NC_019791	TCA	2	6	5664	5669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429216262
128	NC_019791	AT	3	6	5689	5694	50 %	50 %	0 %	0 %	429216262
129	NC_019791	CTG	2	6	5762	5767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429216262
130	NC_019791	GGA	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429216262
131	NC_019791	TAG	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429216262
132	NC_019791	AAG	2	6	5817	5822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429216262
133	NC_019791	TTG	2	6	5849	5854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429216262
134	NC_019791	TAA	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216262
135	NC_019791	ATA	2	6	6003	6008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216263
136	NC_019791	T	6	6	6026	6031	0 %	100 %	0 %	0 %	429216263
137	NC_019791	AAT	2	6	6032	6037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429216263
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270	NC_019791	AT	3	6	10864	10869	50 %	50 %	0 %	0 %	429216268
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